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在亲子鉴定过程中，要满足孩子必定有一条染色体上的基因是来自疑似父亲的，否则就存在疑问了。如果有3个以上的STR座位，不满足这样的孟德尔遗传规律，一般来说就可以排除亲子关系。若个别一两个基因座位不匹配，则可以考虑基因突变的可能，需增加些基因座位进一步辨别。
目前的研究表明，16个STR座位就可区分世界上除了同卵双胞胎之外的所有个体，但是越多的位点数目肯定是越准确的，就是说检测系统的累积非父排除率越接近于1。
